生態(tài)公廁由于其增加了凈化設(shè)施和能源利用設(shè)備，因此其建造費(fèi)用較傳統(tǒng)的公廁要高一些，但是采用新技術(shù)后帶來明顯的節(jié)水、省維修，甚至有附產(chǎn)品產(chǎn)生的好處。

對(duì)生態(tài)公廁的價(jià)值更應(yīng)放在大環(huán)境中去考慮，對(duì)于那些就地實(shí)現(xiàn)廢物的無害化的生態(tài)公廁，它們節(jié)省了糞污處費(fèi)用和對(duì)下水道的依賴，其價(jià)值和重要性更為可觀。因此，生態(tài)公廁建造費(fèi)用較傳統(tǒng)的公廁要高一些。