醫(yī)院污水處理的方法要根據(jù)污水水質(zhì)、污水水量及出水水質(zhì)標準等進行選擇。醫(yī)院污水處理設(shè)備廢水處理方法主要分為化學處理法、物理處理法、和生物處理法三類。（1）化學處理法通過化學反應(yīng)和傳質(zhì)作用來分離、去除廢水中呈溶解、膠體狀態(tài)的污染物或?qū)⑵滢D(zhuǎn)化為無害物質(zhì)的廢水處理法。在化學處理法中，以投加藥劑產(chǎn)生化學反應(yīng)為基礎(chǔ)的處理單元是：混凝、中和、氧化還原等；（2）物理處理法通過物理作用分離、回收廢水中不溶解的呈懸浮狀態(tài)的污染物（包括油膜和油珠）的廢水處理法，可分為重力分離法、離心分離法和篩濾截留法等。屬于重力分離法的處理單元有：沉淀、上浮（氣?。┑?，相應(yīng)使用的處理設(shè)備是沉砂池、沉淀池、隔油池、氣浮池及其附屬裝置等。（3）生物處理法通過微生物的代謝作用，使廢水中呈溶液、膠體以及微細懸浮狀態(tài)的有機污染物，轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定、無害的物質(zhì)的廢水處理法。根據(jù)作用微生物的不同，生物處理法又可分為需氧生物處理和厭氧生物處理兩種類型。

醫(yī)院的污水，除一般生活污水外，還含有化學物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，必須經(jīng)過處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無集中式污水處理設(shè)備的醫(yī)院，對有傳染性的糞便，必須單獨消毒使其無害化。常用消毒劑有漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對含放射性同位素的污水，應(yīng)按同位素處理要求處理。醫(yī)院污水在處理過程中，沉淀的污泥含有大量的細菌、病毒和寄生蟲卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

醫(yī)院污水的水質(zhì)特點是含有大量的病原體──病菌、病毒和寄生蟲卵。如結(jié)核病醫(yī)院污水，每升可檢出結(jié)核桿菌幾十萬至幾百萬個。醫(yī)院污水還含有消毒劑、藥劑、試劑等多種化學物質(zhì)。利用放射性同位素醫(yī)療手段的醫(yī)院的污水還含有放射性物質(zhì)。醫(yī)院污水的水量與醫(yī)院的性質(zhì)、規(guī)模及所在地區(qū)的氣候等因素有關(guān)，按每張病床計一般為每天200～1000升。

醫(yī)院污水處理主要是消毒，即殺滅病原體。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒(見水的消毒、廢水氧化處理法)。