IPTG常用于需要誘導β-半乳糖苷酶活性的克隆實驗。它常與X-Gal或Bluo-Gal結合使用，用于重組細菌菌落的藍白篩選，這些菌落可以誘導lac操縱子在大腸桿菌中的表達。IPTG與lacI阻遏蛋白結合并改變其構象而發(fā)揮作用，防止β-半乳糖苷酶編碼基因lacZ的抑制。

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